无尘车间的设计首先需根据具体的生产流程来规划必要的功能空间，并考虑流程中人员与物料的流向来确保作业效率。在确定了初步的平面布局后，接下来就是明确哪些区域为洁净区、非洁净区，以及这些洁净区的具体洁净度等级。之后，需要计算所需的换气次数或者确定合适的截面风速，进而安排送风和回风口的位置，设计洁净供风机组（包含规格、位置等）和新风管道等。

无尘车间通常由无尘区、近无尘区和辅助区组成。平面布局上，无尘车间有几种设计模式：

外廊环绕式：外廊可以设有窗户或不设窗户，除了美观作用外，还可以放置一些设备，有的外廊内还可以安装供暖设施。对于设窗的外廊，窗户必须是双层密封窗。

内廊式：无尘车间位于建筑外围，内部则设置走廊，这种走廊的洁净度等级通常较高，甚至可能与无尘车间达到同等级。

两侧式：将无尘区布置在一侧，而将近无尘区和辅助用房布置在另一侧。

中心式：为节约用地、简化管线布置，可以将无尘区置于中心位置，四周包围以各类辅助用房和管道空间，这种设计有利于屏蔽室外气候对无尘区的影响，减少冷热能耗，有利于节能。

无论选择哪一种布局，无尘车间的整体设计都应考虑实际生产需求、效率与洁净度要求，以确保无尘环境的有效性和生产流程的合理性。